La etapa de E. Primaria se divide en tres ciclos, cada uno de ellos agrupa a dos niveles; 1º ciclo con los niveles 1º y 2º; 2º ciclo con los niveles 3º y 4º y por último el 3er ciclo con los niveles 5º y 6º.

Contamos con 3 cursos por nivel educativo; por lo tanto en la etapa tenemos 18 grupos.

Entre los objetivos que pretendemos alcanzar en esta etapa, se encuentran desarrollar la autoestima, lograr la capacidad de trabajar en grupo, mejorar la la comprensión y el conocimiento del euskera, así como la capacidad de comunicación, descubrir los valores evangélicos…

Para la consecución de los objetivos propuestos para la etapa, podemos citar las siguientes actividades:

- Animación a la lectura.
- Proyecto de inmersiones lingüísticas.
- Tutoría con los alumnos.
- Obras teatrales en el Colegio.
- Atención a nuestra cultura y tradición; Olentzero, Santa Águeda, Semana del euskara, Korrika, Carnavales...
- Diferentes salidas y actividades programadas a lo largo del curso.